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中国科学家:新冠病毒已演化出两个亚型毒力区别大;巴西科学家已
发布日期:2022-04-21 05:07   来源:未知   阅读:

  3月3日,中国科学院主办的《国家科学评论》(National Science Review)发表题为《关于SARS-CoV-2的起源和持续进化》的论文,通过对迄今最大规模的新冠病毒全基因组分子进化分析,揭示了新冠病毒已经演化出L和S两个亚型。

  中国科研团队最新发现显示:新冠病毒已于近期产生了149个突变点,并演化出了两个亚型,分别是L亚型和S亚型。研究发现,在地域分布及人群中的比例,这两个亚型表现出了很大测差异。

  论文通讯作者为陆剑研究员(北京大学生命科学学院生物信息中心)、崔杰研究员(中国科学院上海巴斯德研究所)。

  在这103个病毒株中,有101个属于两个亚型之一。具体而言,两个亚型的区别在于病毒RNA基因组的第28144位点,L型是T碱基(对应亮氨酸,Leu),S型是C碱基(对应丝氨酸,Ser)。通过与其他冠状病毒比较,作者发现S型新冠病毒与蝙蝠来源的冠状病毒在进化树上更接近,从而得出S型相对更古老的结论。

  但研究人员意外发现,相对古老的S型新冠病毒并没有因为在人群中传播的时间更长,而感染更多的人。基因组数据表明,感染S型的比例占30%,反倒是相对年轻的L型新冠病毒的感染比例占70%,而且每个L型病毒株比S型携带了相对更多的新生突变。

  基于上述反常现象,作者推测:“L型病毒传播能力更强,或者在人体内复制更快,因此可能意味着其毒力也更大。”

  作者还专门比较了1月7日前后S型和L型所占比例的变化,他们发现L型在病毒株中的比例下降,S型比例上升。作者由此推测:“这可能是因为L型病毒的患者更容易表现出症状,因而更容易受到人工干预,从而使L型新冠病毒受到的负选择压力更大,感染的人数由此变少。”

  L亚型在武汉爆发的早期阶段更为普遍,而L亚型的发生频率在2020年1月初后有所下降。作者认为,人为干预可能对L亚型施加了更大的选择性压力,如果没有这些干预,L亚型可能更具侵略性和扩散得更快速。另一方面,由于选择压力相对较弱,在进化上较老且攻击性较小的S型可能在相对频率上有所增加。这些发现意味着,目前迫切需要结合基因组数据、流行病学数据和2019年冠状病毒病患者临床症状图表记录,进行进一步的全面研究。

  103个新冠病毒毒株的衍生突变频谱分析,橘黄色为非同义突变、绿色为同义突变

  另外,值得注意的是,这103个样本显示,大部分患者只感染了L亚型或S亚型中的一个。但其中一位近期有过武汉旅行史的美国患者分离出的病毒株,这两个位点却均呈现了C和T的混合现象,也就是说,很有可能这位患者同时感染了L型和S型新冠病毒。不过,作者表示目前还无法排除新突变型的可能性。

  巴西在2月26日出现首例确诊病例。当地科学家与英国科学家合作,紧急针对该名61岁的巴西患者进行“冠状病毒基因定序”,结果发现这名患者体内的新冠病毒同武汉公布的病毒基因相比存在3处不同,表示病毒在传播过程中已经发生突变。

  据南方都市报,3月1日,一份发表在病毒学国际交流平台(Virological),题为《First report of COVID-19 in South America》(南美洲首例新型冠状病毒报告)引发关注,这是南美洲首次分析出新冠病毒的基因序列,由巴西Adolfo Lutz国家研究所、国家参考实验室,以及圣保罗大学(USP)、牛津大学热带医学研究所共同完成。

  据报告介绍,该名巴西首例确诊新冠肺炎患者为61岁男性,来自圣保罗市。他于2020年2月9-21日,曾前往意大利北部的伦巴第旅游。在返回巴西后,他出现发烧和呼吸道症状,包括干咳、喉咙痛、流鼻涕等。2月25日,他在圣保罗阿尔伯特·爱因斯坦医院进行了新冠肺炎的诊断筛查,26日确诊为新冠肺炎患者。

  研究人员从该名患者的鼻咽中提取病毒基因,进行“冠状病毒基因定序”,原本需要花15天的工程,在48小时内完成。

  报告指出,初步的遗传分析表明,这株巴西“Brazil/SPBR1/2020”病毒的基因组,跟中国此前公布的 “Hu-1参考菌株”有3处不同,表示病毒在传播的过程中已经开始突变。而这些突变中,有两处跟德国慕尼黑群聚传染事件中提取的病毒“德国/ BavPat1/2020菌株”非常接近。这个结果表示,在欧洲传播的新冠病毒已经跟原本在中国传播的病毒有所不同。

  据看看新闻,研究团队表示,目前意大利只公布了一个病毒基因组序列,来自一位东亚地区的女游客,属于 “境外输入病毒 ”。但随着确诊病例越来越多,有必要针对意大利本土病例重新进行病毒分析。“意大利北部的伦巴第地区,正好是出现第一例意大利本土病例的地方,所以我们分析的病毒基因或许可以代表新的发现,包括病毒的变异。”

  研究团队将这份资料公开,希望各国能共享研究成果,避免病毒在大家不清楚其已变异的情况下传播,引发更多不确定的突变。

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